Mesleki kariyerine avukatlık stajını tamamlamasının ardından 2003 yılında Sermaye Piyasası Kurulunda meslek personeli olarak başlamıştır. Burada Uzman Hukukçu, Denetçi ve Piyasa Denetim Grubu Başkanı olarak görev yapmıştır. 2013’te PwC İstanbul ofisinde finans hukuku hizmetlerinden sorumlu yönetici olarak çalışmaya başlamıştır. 2016 yılında ise Özelleştirme İdaresi Başkan Yardımcısı olarak atanmıştır. Şubat 2019’dan itibaren Özelleştirme İdaresi Başkanlığı görevini yürütmektedir.
Ankara Üniversitesi Hukuk Fakültesi’nden 2001 yılında mezun olan Bekir Emre Haykır, King’s College London’da Uluslararası Finans Hukuku, Bahçeşehir Üniversitesi’nde ise Avrupa Birliği Çalışmaları yüksek lisans programlarını tamamlamıştır.
1980 Ankara doğumlu olup evli ve 2 çocuk babasıdır.